潜艇是水下的刺客，这种作战单位会潜伏在水下等待攻击的时机，使用鱼雷或者反潜导弹将目标彻底摧毁，然后迅速离开交战区域。除了攻击潜艇之外还有一些长时间潜藏在水下的战略导弹潜艇，这种潜艇一般并不会浮出水面，要想攻击到这种潜艇困难重重，但是随着反潜技术的发展，人们并不是对深藏于水下的潜艇束手无策，相反有着很多找到他们的方法。

攻击藏在水下的潜艇要分为两个阶段，首先就是索敌阶段，在这个时候水面舰艇会下放拖曳式主动变深声呐，用于找到水下的“异物”。当然被动声呐也会全部打开。飞在天上的反潜直升机同样会下放拖曳声呐或者投放声呐浮标。当然有人奇怪为什么不在水下使用雷达，这个问题初中物理课上就明确讲过，电磁波在水下的传播距离是非常近的，只有三五米，所以人们才会使用声呐探测水下。

在找到潜艇之后，水面舰艇会发射反潜火箭弹，比如中国在054A甲板上布置的反潜火箭发射器。当然如果有反潜导弹（火箭助飞鱼雷）的话就更好了，这种武器的精度要比反潜火箭好得多，虽然反潜火箭更容易打出饱和式攻击。而反潜直升机会发射携带的轻型鱼雷对水下的潜艇进行打击，可以说想要对付深浅的潜艇的方法还是很多的。

如果是潜艇进行反潜的话，那么基本就是相互锁定之后用各种鱼雷和鱼雷干扰装置进行互殴，毕竟水下的环境要比水上的环境复杂的多，至于有人质疑说潜艇可以往更深处下潜来躲避打击，但是潜艇是要载人的，一般来说最深下潜深度只有300米左右而反潜火箭或者其他武器的攻击深度都高于水下300米。